生物医学研究所(IRB Barcelona)的科学家与斯隆·凯特林研究所(Sloan Kettering Institute)(美国纽约)合作,发表了区分两个非常相似的转录因子SMAD2和SMAD3的结构和功能键。
SMAD形成一个蛋白质家族,该蛋白质调节与胚胎发育,细胞再生和免疫反应等过程相关的基因的表达。尽管几乎相同,SMAD2对于胚胎发育必不可少,而SMAD3却很消耗。
在这项研究中,我们已经能够回答为什么具有如此相似序列的两种蛋白质SMAD2和SMAD3在胚胎发育过程中发挥如此不同的作用的原因。”
MaríaJ. Macias,ICREA研究人员,巴塞罗那IRB高分子组装实验室结构表征负责人
通过将分子生物学,细胞生物学,发育生物学和结构生物学专业知识相结合的多学科方法,该研究小组发现,两种转录因子之间差异的关键在于SMAD2的30个氨基酸区域。 SMAD3中不存在。
“由于它们的序列是如此相似,所以迄今为止很难用现有工具单独研究SMAD2和SMAD3,而且它们的功能也被混淆了。对高分辨率技术(如核磁共振和晶体学)的微调使我们得以区分Macias强调说,“这项研究是两个小组的科学家5年的工作成果”。
反驳信念:SMAD2确实与DNA结合
SMAD2-中不存在的30个氨基酸区段采用开放结构,SMAD3-中不存在-允许直接DNA结合并激活发育中关键基因的表达。因此,这一发现反驳了迄今为止被认为SMAD2是不与DNA结合的转录因子的理论。
“我们已经观察到,正确折叠SMAD2后,它可以直接与DNA的双螺旋相互作用。对SMAD2结构的研究表明,它可以发生三维变化,从而导致蛋白质的两个取向,一个兼容DNA结合,另一个不兼容。” Macias小组成员,文章的第一作者之一埃里克·阿拉贡(EricAragón)说道。